在减抗背景下，蛋鸡细菌性疾病日益严峻，且种类繁多、血清型复杂，防控难度加大。禽沙门菌、致病性大肠杆菌、副鸡嗜血杆菌等重要病原菌对蛋鸡产业造成了严重危害，导致显著的经济损失。此外，病原菌的耐药性问题已成为全球公共卫生的新威胁。
近日，四川大学三级教授张安云以《蛋鸡细菌性疾病系统防控与噬菌体疗法底层设计》，为题，探讨了蛋鸡产业链病原细菌溯源技术、细菌病的系统防控与噬菌体疗法底层设计等。
四川大学三级教授张安云在新禽况主办的2025品牌蛋高峰论坛暨第八届邕江论坛上分享《蛋鸡细菌性疾病系统防控与噬菌体疗法底层设计》主题报告。
多项技术加持
精准溯源病原风险
针对当前细菌病的防控，行业已有共识：要么尽可能减少抗生素使用，要么就是种源净化，即从源头防控。
“宏基因组测序技术、多组学蛋鸡产业链病原菌溯源技术等新技术的加持，让病原溯源、疫病净化得以更高效地实现。”张安云表示，通过对病原菌的溯源，识别关键风险点是源头防控的前提。
张安云教授基于源头防控的角度，提出几个蛋鸡产业链病原菌溯源技术，护航蛋鸡健康生产。首先是病原菌基因组学溯源方法，该方法包含三个核心维度：一是能够确定病原菌类型，二是能分析其独立基因、耐药基因、药物敏感性和毒性，三是明确其与其他病原菌的亲缘关系。通过这些信息，我们可以进行溯源，识别关键风险点。
其次是宏基因组测序技术，该技术不需要分菌，通过直接提取养殖环境中所有微生物的DNA并进行高通量测序，可系统性解析样本中的微生物组成及其相对丰度。通过比较不同环境样本中细菌类群特征及其携带的抗性基因，揭示防控关键点，实现源头精准防控。
最后是全基因组测序技术，是对生物个体的完整基因组DNA序列进行测序，可以鉴定遗传病、研究物种进化、探究基因组结构和功能等。张安云解释道“这个技术跟我们人的亲子鉴定非常类似，就是拿基因组的相似性进行对比，来阐明它们之间这种传播关系”。
多组学蛋鸡产业链病原菌溯源技术可实现两大功能：一是全球范围内追溯主要病原菌来源及集中感染时间；二是精准定位鸡舍内生物媒介的病原溯源，锁定防控关键点以指导精准防控。
张安云教授团队通过细菌比较基因组“亲子鉴定”溯源技术发现，饲料、空气、水等非生物媒介及鼠、苍蝇等生物媒介是细菌的关键传染源与传播途径，为养殖场净化与精准防控提供了科学支撑。
创新检测助力
实现精准阻断
张安云教授表示“通过溯源技术，可以找到蛋鸡产业链中精准的防控点，得知哪个环节病原最多、危险最大，下一步就可以针对性的精准防控、精准阻断。”
在精准阻断技术方面，张安云教授提出了几个创新系列蛋鸡常见病原细菌快速检测方法，包括鸡白痢沙门菌鉴别PCR技术、可视化沙门氏菌LAMP检测技术、沙门菌纳米抗体及ELISA检测方法、免疫磁珠快速检测病原菌技术、生物荧光传感器检测沙门菌技术等。
研究发现,当前鸭疫里默氏杆菌具有稳定向蛋鸡传播的可能，张安云教授团队从15个蛋鸡养殖场分离鸭疫里默氏杆菌51株，通过与全球273株来源于蛋鸡、鸭、鹅的菌株基因组比较分析，发现其具有跨宿主和跨地域传播的风险，并表明了基因组进化中在第三阶段具有稳定向蛋鸡传播的可能。此外，鸭疫里默氏杆菌可引起蛋鸡呼吸道病症，也可能引起副鸡禽杆菌、鸟杆菌的混合感染，需得到重视。
副鸡禽杆菌引起的鸡传染性鼻炎在冬春季节多发，在山东、安徽、湖北等地流行，且在规模化蛋鸡场具有极强的传播性，鸡舍中间笼排和后部感染率最高，为传染高风险点。通过宏基因组技术揭示副鸡禽杆菌感染可能与鸡场侧边进风口和鸡舍风向设置有关。张安云建议通过一些物理方式来防病，如在鸡舍之间增加挡板，减少侧边通风以及减少养殖密度等。
张安云教授表示，在养殖场中要想做好蛋鸡疾病防控，系统的生物安全防控一定要跟上，落实养殖场防鼠、防蝇等生物安全措施，可牢记王红宁教授总结的几个关键点，即：全进全出、精准消毒、粪不落地、料不见天、鼠不进舍、舍不见蝇。
创新噬菌体疗法应用
开启无抗养殖新纪元
在后抗生素时代，噬菌体疗法重新受到人们的重视，成为研究热点，带来新的机遇。张安云教授课题组过去几年对噬菌体疗法在蛋鸡细菌病防控当中的应用做了一些初步探索。
张安云教授团队建立了基于基因编辑的噬菌体结合位点鉴定平台，构建了沙门菌和噬菌体交叉感染矩阵，完成了基于机器学习的鸡尾酒理性设计算法设计。尤其是针对噬菌体对病原菌产生抗性的演变过程和抗性权衡机理进行了详细研究，优化鸡尾酒设计会大幅降低病原菌对噬菌体产生抗性的时间。在养殖场中试验，设计沙门菌和克雷伯菌噬菌体鸡尾酒体外消毒评价，在MOI=1:1000时，噬菌体消毒剂样本对各样本的沙门菌和克雷伯菌具有显著杀菌效果，而消毒剂已近乎失效。同时，噬菌体鸡尾酒处理对形成生物被膜的宿主菌有明显的杀灭效果。
此外，在洗蛋环节时用噬菌体也是一个非常好的应用场景。噬菌体也可作为在动物体内雏鸡开口药的替代品，如噬菌体治疗相比于四环素可以有效抑制雏鸡体内沙门菌定植，而四环素的投喂显著增加了四环素耐药基因的相对丰度，但噬菌体对其无显著影响。
张安云表示：“虽然噬菌体起效比抗生素慢，但是它持续抑菌效果比抗生素好，不会导致肠道微生物紊乱和耐药菌的富集，有些噬菌体还可以和抗生素联用，起到1+1大于2的作用。”
会议现场
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